Mặc dù MLS đang phát triển mạnh mẽ, nhưng giải đấu này vẫn phải đối mặt với một số thách thức lớn. Một trong những vấn đề lớn nhất mà giải đấu phải đối mặt là sự cạnh tranh từ các giải đấu lớn hơn ở châu Âu. Các cầu thủ đẳng cấp thế giới vẫn ưu tiên thi đấu ở những giải đấu như Premier League, La Liga, và Serie A, điều này khiến MLS gặp khó khăn trong việc thu hút những ngôi sao lớn nhất của bóng đá quốc